MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome

Total Repeats: 112132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004663	ACG	2	6	112	117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345411
2	NC_004663	ACG	2	6	229	234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345411
3	NC_004663	TCAC	2	8	259	266	25 %	25 %	0 %	50 %	29345411
4	NC_004663	TG	3	6	427	432	0 %	50 %	50 %	0 %	29345411
5	NC_004663	TGT	2	6	464	469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345411
6	NC_004663	TAC	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345411
7	NC_004663	CTG	3	9	520	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345411
8	NC_004663	ACT	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345411
9	NC_004663	TGG	2	6	668	673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345411
10	NC_004663	ATG	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345412
11	NC_004663	TCA	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345412
12	NC_004663	ACA	2	6	902	907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345412
13	NC_004663	AAG	2	6	914	919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345412
14	NC_004663	A	6	6	946	951	100 %	0 %	0 %	0 %	29345412
15	NC_004663	ATA	2	6	1054	1059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345412
16	NC_004663	TTC	2	6	1106	1111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345412
17	NC_004663	GGA	2	6	1118	1123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345412
18	NC_004663	ACA	2	6	1128	1133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345412
19	NC_004663	TA	3	6	1174	1179	50 %	50 %	0 %	0 %	29345412
20	NC_004663	AAT	2	6	1191	1196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345412
21	NC_004663	TA	3	6	1224	1229	50 %	50 %	0 %	0 %	29345412
22	NC_004663	TAT	2	6	1307	1312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345412
23	NC_004663	CTT	2	6	1355	1360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345412
24	NC_004663	AT	3	6	1363	1368	50 %	50 %	0 %	0 %	29345412
25	NC_004663	GAA	2	6	1377	1382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345412
26	NC_004663	CTG	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345412
27	NC_004663	CAA	2	6	1516	1521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345412
28	NC_004663	ATG	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345412
29	NC_004663	GTA	2	6	1587	1592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345412
30	NC_004663	TAA	2	6	1637	1642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345412
31	NC_004663	ATA	2	6	1684	1689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345412
32	NC_004663	TGCAA	2	10	1741	1750	40 %	20 %	20 %	20 %	29345412
33	NC_004663	TATCT	2	10	1754	1763	20 %	60 %	0 %	20 %	29345412
34	NC_004663	AC	3	6	1877	1882	50 %	0 %	0 %	50 %	29345413
35	NC_004663	ACA	2	6	1921	1926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345413
36	NC_004663	AAG	2	6	1927	1932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345413
37	NC_004663	GGA	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345413
38	NC_004663	GAA	2	6	1994	1999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345413
39	NC_004663	AGA	2	6	2000	2005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345413
40	NC_004663	GAA	2	6	2019	2024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345413
41	NC_004663	GT	3	6	2056	2061	0 %	50 %	50 %	0 %	29345413
42	NC_004663	GTG	2	6	2128	2133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345413
43	NC_004663	TAG	2	6	2134	2139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345413
44	NC_004663	CGG	2	6	2141	2146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29345413
45	NC_004663	A	7	7	2158	2164	100 %	0 %	0 %	0 %	29345413
46	NC_004663	GA	3	6	2242	2247	50 %	0 %	50 %	0 %	29345413
47	NC_004663	TA	3	6	2262	2267	50 %	50 %	0 %	0 %	29345413
48	NC_004663	GCC	2	6	2283	2288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345413
49	NC_004663	ACGG	2	8	2298	2305	25 %	0 %	50 %	25 %	29345413
50	NC_004663	CCG	2	6	2314	2319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345413
51	NC_004663	GGTA	2	8	2375	2382	25 %	25 %	50 %	0 %	29345413
52	NC_004663	CTGA	2	8	2388	2395	25 %	25 %	25 %	25 %	29345413
53	NC_004663	TGG	2	6	2434	2439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345413
54	NC_004663	AAC	2	6	2442	2447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345413
55	NC_004663	ACGG	2	8	2484	2491	25 %	0 %	50 %	25 %	29345413
56	NC_004663	GTA	2	6	2554	2559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345413
57	NC_004663	GTG	2	6	2587	2592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345413
58	NC_004663	ATGA	2	8	2834	2841	50 %	25 %	25 %	0 %	29345414
59	NC_004663	GAAT	2	8	2859	2866	50 %	25 %	25 %	0 %	29345414
60	NC_004663	TGC	2	6	2889	2894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345414
61	NC_004663	TGT	2	6	2895	2900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345414
62	NC_004663	AGAA	2	8	3240	3247	75 %	0 %	25 %	0 %	29345414
63	NC_004663	CAA	2	6	3263	3268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345414
64	NC_004663	AAT	2	6	3277	3282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345414
65	NC_004663	CAT	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345414
66	NC_004663	ATC	2	6	3398	3403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345414
67	NC_004663	GAA	2	6	3475	3480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345415
68	NC_004663	TCT	2	6	3522	3527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345415
69	NC_004663	CAAA	2	8	3615	3622	75 %	0 %	0 %	25 %	29345415
70	NC_004663	TGA	2	6	3656	3661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345415
71	NC_004663	GTGCC	2	10	3703	3712	0 %	20 %	40 %	40 %	29345415
72	NC_004663	GGA	2	6	3903	3908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345415
73	NC_004663	TGTAG	2	10	3910	3919	20 %	40 %	40 %	0 %	29345415
74	NC_004663	TGCT	2	8	3929	3936	0 %	50 %	25 %	25 %	29345415
75	NC_004663	CTG	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345416
76	NC_004663	CTTG	2	8	4115	4122	0 %	50 %	25 %	25 %	29345416
77	NC_004663	GAT	2	6	4142	4147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345416
78	NC_004663	AGAA	2	8	4173	4180	75 %	0 %	25 %	0 %	29345416
79	NC_004663	TA	3	6	4300	4305	50 %	50 %	0 %	0 %	29345416
80	NC_004663	ATA	2	6	4311	4316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345416
81	NC_004663	AAG	2	6	4412	4417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345416
82	NC_004663	AAT	2	6	4551	4556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345417
83	NC_004663	AT	3	6	4565	4570	50 %	50 %	0 %	0 %	29345417
84	NC_004663	AAG	2	6	4595	4600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345417
85	NC_004663	T	6	6	4620	4625	0 %	100 %	0 %	0 %	29345417
86	NC_004663	AGG	2	6	4790	4795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345417
87	NC_004663	AAT	2	6	4797	4802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29345417
88	NC_004663	GGA	2	6	4839	4844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345417
89	NC_004663	AAAT	2	8	4965	4972	75 %	25 %	0 %	0 %	29345418
90	NC_004663	GA	3	6	5009	5014	50 %	0 %	50 %	0 %	29345418
91	NC_004663	TAT	2	6	5056	5061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345418
92	NC_004663	GAAT	2	8	5062	5069	50 %	25 %	25 %	0 %	29345418
93	NC_004663	TGCT	2	8	5091	5098	0 %	50 %	25 %	25 %	29345418
94	NC_004663	GTTA	2	8	5099	5106	25 %	50 %	25 %	0 %	29345418
95	NC_004663	A	6	6	5213	5218	100 %	0 %	0 %	0 %	29345418
96	NC_004663	CAG	2	6	5253	5258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345418
97	NC_004663	GCA	2	6	5310	5315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345418
98	NC_004663	TTA	2	6	5346	5351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345418
99	NC_004663	GAA	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345418
100	NC_004663	T	6	6	5425	5430	0 %	100 %	0 %	0 %	29345418
101	NC_004663	TGA	2	6	5446	5451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345418
102	NC_004663	TTA	2	6	5471	5476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345418
103	NC_004663	TAT	2	6	5477	5482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29345418
104	NC_004663	ATG	2	6	5492	5497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345418
105	NC_004663	CAA	2	6	5636	5641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29345419
106	NC_004663	GCA	2	6	5710	5715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345419
107	NC_004663	TTTA	2	8	5718	5725	25 %	75 %	0 %	0 %	29345419
108	NC_004663	GAG	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345419
109	NC_004663	CCG	3	9	5789	5797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29345419
110	NC_004663	GAA	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345419
111	NC_004663	GAA	2	6	5910	5915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345419
112	NC_004663	ATG	2	6	6110	6115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345419
113	NC_004663	GCAA	2	8	6140	6147	50 %	0 %	25 %	25 %	29345419
114	NC_004663	GGTA	2	8	6324	6331	25 %	25 %	50 %	0 %	29345419
115	NC_004663	CAGC	2	8	6371	6378	25 %	0 %	25 %	50 %	29345419
116	NC_004663	GGT	2	6	6534	6539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29345419
117	NC_004663	GAA	2	6	6586	6591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345419
118	NC_004663	GCT	2	6	6600	6605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345419
119	NC_004663	AGG	2	6	6704	6709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345419
120	NC_004663	ACG	2	6	6716	6721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345419
121	NC_004663	AAAG	2	8	6812	6819	75 %	0 %	25 %	0 %	29345420
122	NC_004663	AGAAC	2	10	6873	6882	60 %	0 %	20 %	20 %	29345420
123	NC_004663	GAT	2	6	6928	6933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345420
124	NC_004663	CTG	2	6	7042	7047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345420
125	NC_004663	AGA	2	6	7056	7061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29345420
126	NC_004663	GCT	2	6	7069	7074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345420
127	NC_004663	TCC	2	6	7126	7131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29345420
128	NC_004663	TGT	2	6	7187	7192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345420
129	NC_004663	TCA	2	6	7340	7345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345420
130	NC_004663	T	6	6	7369	7374	0 %	100 %	0 %	0 %	29345420
131	NC_004663	CATGA	2	10	7489	7498	40 %	20 %	20 %	20 %	29345420
132	NC_004663	CTG	2	6	7591	7596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29345420
133	NC_004663	CGTT	2	8	7715	7722	0 %	50 %	25 %	25 %	29345420
134	NC_004663	GAAA	2	8	7788	7795	75 %	0 %	25 %	0 %	29345420
135	NC_004663	GGA	2	6	7821	7826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345420
136	NC_004663	AATGG	2	10	8074	8083	40 %	20 %	40 %	0 %	29345421
137	NC_004663	AGCA	2	8	8105	8112	50 %	0 %	25 %	25 %	29345421
138	NC_004663	AGC	2	6	8121	8126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345421
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161	NC_004663	TGA	2	6	9329	9334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345422
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165	NC_004663	GCCA	2	8	9652	9659	25 %	0 %	25 %	50 %	29345422
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172	NC_004663	ACGG	2	8	10056	10063	25 %	0 %	50 %	25 %	29345422
173	NC_004663	TGA	2	6	10091	10096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345422
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256	NC_004663	GGAA	2	8	13766	13773	50 %	0 %	50 %	0 %	29345425
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263	NC_004663	GTT	2	6	14175	14180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29345425
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269	NC_004663	ATG	2	6	14450	14455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29345425
270	NC_004663	CAT	2	6	14475	14480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345425
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274	NC_004663	GAG	2	6	14843	14848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29345426
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355	NC_004663	CAT	2	6	20332	20337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29345434
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381	NC_004663	CTT	2	6	22629	22634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29345438
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389	NC_004663	TA	3	6	23134	23139	50 %	50 %	0 %	0 %	29345439
390	NC_004663	AATAA	2	10	23179	23188	80 %	20 %	0 %	0 %	29345439
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394	NC_004663	A	7	7	23252	23258	100 %	0 %	0 %	0 %	29345439
395	NC_004663	CGTC	2	8	23311	23318	0 %	25 %	25 %	50 %	29345439
396	NC_004663	ACG	2	6	23368	23373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29345439
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399	NC_004663	AT	3	6	23542	23547	50 %	50 %	0 %	0 %	29345439
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